Het Departement van Waterstaat stond tot september 1943 onder leiding van secretaris-generaal mr. D.G.W. Spitzen, en daarna to midden 1944 van ir. W.L.Z. van der Vegte. Toen werd het departement gesplitst: er kwam een Departement van Verkeerswezen onder ir. Van Dieren als secretaris-generaal; Van der Vegte bleef met de leiding van de rest van het Departement van Waterstaat belast.